基本信息
- 英文名称:Abz-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-EDDnp trifluoroacetate salt
- 中文名称:三氟乙酸盐 Abz-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-EDDnp
- 氨基酸序列:2 - 氨基苯甲酰基 - 缬氨酸 - 天冬酰胺 - 亮氨酸 - 天冬氨酸 - 丙氨酸 - 谷氨酸 - 2-(2,4 - 二硝基苯基) 乙二胺
- 单字母序列:{Abz}-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-{EDDnp}
- 三字母序列:{Abz}-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-{EDDnp}
- 分子量:986.98
- 分子式:C₄₂H₅₈N₁₂O₁₆
- 等电点:由于其结构和组成的复杂性,准确计算等电点较为困难,且相关文献中未明确提及,若需精确值,可通过专业软件或实验测定。
- CAS 号:1007306 - 20 - 8
结构信息
Abz-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-EDDnp 由 7 个常规氨基酸(缬氨酸、天冬酰胺、亮氨酸、天冬氨酸、丙氨酸、谷氨酸)和两个特殊基团(2 - 氨基苯甲酰基 Abz 和 2-(2,4 - 二硝基苯基) 乙二胺 EDDnp )组成。这些氨基酸通过肽键依次连接,形成线性的多肽链。Abz 基团位于 N 端,EDDnp 基团位于 C 端 。其中,天冬氨酸和谷氨酸属于酸性氨基酸,其侧链含有羧基,在生理 pH 下可解离出氢离子带负电;缬氨酸、亮氨酸等属于非极性氨基酸,对多肽的疏水性有重要影响;天冬酰胺是极性中性氨基酸。这种氨基酸组成和排列赋予了多肽特定的空间构象和理化性质。
作用机理及研究进展
- 作用机理:它是一种淬灭荧光底物。在特定的酶促反应体系中,当遇到能够识别并作用于该多肽序列的酶时,酶会切割多肽链中的特定肽键。随着肽键的断裂,Abz 和 EDDnp 之间的距离发生变化,从而打破原来的荧光共振能量转移(FRET)体系。原本被 EDDnp 淬灭的 Abz 荧光得以恢复,通过检测荧光强度的变化,就能实时监测酶促反应的进程,从而对相关酶的活性、动力学参数等进行研究。例如在 β- 分泌酶的研究中,该底物被用于检测 β- 分泌酶的活性。
- 研究进展:主要应用于生物化学和细胞生物学领域的酶学研究。通过使用 Abz-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-EDDnp 作为底物,可以深入了解酶的作用机制、筛选酶的抑制剂或激活剂。在药物研发前期,利用它来评估潜在药物对特定酶的影响,为新药的开发提供理论依据。同时,在细胞生理病理过程中,涉及到相关酶活性变化的研究,也常用到该底物来检测酶活变化。
溶解保存
- 溶解:
- 首先计算该多肽的整体电荷,它含有 2 个酸性氨基酸(天冬氨酸、谷氨酸),整体电荷为负。可先尝试用无菌水溶解。如果在水中溶解度不佳,可加入少量(<50μl )的氨水促进溶解。若仍不溶解,可加入 50 - 100μl 的 DMSO(二甲基亚砜)来溶解多肽 。
- 溶解时要缓慢加入溶剂,并不断搅拌或振荡,促进多肽的溶解。同时,注意溶解过程中的温度,一般在室温下进行,避免温度过高或过低影响多肽的稳定性和溶解性。
- 保存:建议保存在 - 20℃±5℃的低温环境中,以保持其化学稳定性和生物活性。保存时最好将其分装成小份,避免反复冻融,因为反复冻融可能会导致多肽的降解和活性丧失。在取用多肽时,应在干冰环境下操作,减少其在室温下的暴露时间。
相关多肽
与 Abz-Val-Asn-Leu-Asp-Ala-Glu-EDDnp 相关的多肽通常是具有类似结构或功能的淬灭荧光底物。例如,其他含有不同氨基酸序列,但同样带有荧光基团和淬灭基团的多肽,如 Abz-Leu-Ala-Gln-Ala-Val-Arg-Ser-Ser-Ser-Arg-Dap (DNP)-NH₂ ,它是 ADAM17/TNF-α 转换酶的荧光淬灭底物 。这些相关多肽可能用于研究不同的酶,或者在相同酶的研究中,通过对比不同底物的反应情况,更深入地了解酶的底物特异性和催化机制。
相关文献
Mancini F, et al. Development and characterization of beta - secretase monolithic micro - immobilized enzyme reactor for on - line high - performance liquid chromatography studies. J Chromatogr A. 2007 Dec 21;1175(2):217 - 26.
供应商:上海楚肽生物科技有限公司返回搜狐,查看更多