在微生物的研究中，常需要展示不同物种在样品中的分布情况，常规的展示图表有如堆叠图、聚类热图等。在大量高分文章中，也常看到使用circos来展示关系型数据，同样地，我们也可以使用circos图对物种与样本关系可视化。
（ Nature ,2011）
绘制Circos图的方法有繁有简。如果有一定的生信基础，掌握perl语言或者R语言，可以安装circos软件绘制；当然，也可以使用OmicShare Tools的circos物种关系图进行绘制，只需上传OTU丰度表即可绘制，大大节省了精力和时间。
工具链接：
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/circos
数据准备
工具可以选用物种分类水平作图，因此上传的丰度表格必须带有物种注释。
OTU丰度表
如果样本中有分组，还可以选择上传分组文件，左列样本名称，右列为分组名。
分组文件
参数选择
Circos物种关系图可以选择门(phylum)/纲(class)/目(order)/科(family)/属(genus)/种(species)，六个分类水平进行绘图。
最多只能选择分类水平下丰度前10的物种进行展示，超过10个，则其他归为Others；不足10个物种，则自动使用全部物种作图，也可以自定义展示的物种数（不超过10）。
Circos图结果
Circos图中左侧为物种，右侧则为样本，左侧为物种，各用不同颜色表示。连线则为样本与物种的关系，线段越粗，表明该物种在该样本中越丰富。
如下图中，深紫色代表的Pontibacter，其跟TC-3的连线最粗，CK-1连线最细，则Pontibacter这一物种在TC-3中是更丰富的。
而同一个样本TC-3中，浅蓝色占比最大，则说明TC-3这个样本中，Sphingomonas最丰富。
除了物种与样本关系，Circos图还适用于转录组、微生物、代谢物等数据分布展示，如分组+基因/功能+表达量；Go term+上下调+基因数量；分组+富集的代谢通路+通路的基因数量等。
绘制也可以使用OmicShare Tools的另一个工具：动态Circos图，欢迎大家探索绘制~
参考文献
[1]Berger MF, Lawrence MS, Demichelis F ，et al.The genomic complexity of primary human prostate cancer .Nature 470:214-220(2011).
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