科技频道-搜狐网站> 科学频道 > 生科·医学
互联网 | 通信 | IT业界 | 自媒体

我国主导完成世界首张西瓜基因组图谱绘制

2012年11月26日10:03
来源:搜狐科学

  【搜狐科学消息】11月25日下午,西瓜基因组绘制成果发布会在北京农林科学院蔬菜研究中心举行,这是我国主导完成的世界首张西瓜基因组序列图谱,研究成果于北京时间11月26日凌晨在国际顶级学术刊物《自然•遗传学》(Nature Genetics)在线发表。

  西瓜是世界五大水果之一,是重要的夏季消暑水果,其基因组图谱的完成,意味着人类掌握了西瓜的遗传“密码”,这对未来进一步改良西瓜的口感、瓤色、抗病虫害等都具有重要意义,同时在学术上,还可以为葫芦科植物比较基因学研究提供重要数据资源。

  本次的西瓜基因组图谱绘制是国际西瓜基因组计划的一部分,该计划由北京市农林科学院组织发起,前后共进行了四年多的时间,终于完成了西瓜的全基因组序列图谱。这是我国科学家主导完成的世界上首张西瓜基因组序列图谱,也是植物基因组研究领域的一个新的突破性成果,标志着我国在西瓜基因组学研究领域取得了国际领先地位。该研究成果已于北京时间今日凌晨两点在《自然•遗传学》(Nature Genetics)杂志上发表。

  北京市农林科学院蔬菜研究中心主任、国家西甜瓜产业体系首席科学家许勇研究员作为国际西瓜基因组计划牵头人,组织美国康奈尔大学、深圳华大基因研究院、美国加州大学戴维斯分校、法国农业科学院、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、新疆农科院、先正达与瑞克斯旺公司等国内外16家科研和育种机构60余名科研人员联合完成了国际西瓜基因组计划。科研人员采用“全基因组鸟枪法”测序策略,进行双末端测序,得到总量约为46G的基因序列数据,历经4年多的艰苦努力,获得了高质量的西瓜基因组序列。拼接后的序列覆盖83.2%的西瓜基因组,共包含23440个编码基因,其中96.8% (22,682个)的基因已经精确定位到染色体上。同时完成了20份代表性西瓜资源的基因组重测序,获得了678万个SNP位点和96万个InDel位点。

  进化分析表明,现代栽培西瓜11对染色体是由7对祖先染色体经历了古六倍体化事件、81次断裂和91次融合进化而来,半野生西瓜Citrulluslanatus subsp. mucosospermus是现代栽培西瓜Citrullus lanatus subsp. vulgaris最直接的祖先。从半野生西瓜到现代栽培西瓜的驯化过程中,多个基因组区域受到强烈选择,进而形成了现代栽培西瓜具有的含糖量高、早熟等生物学特征,而大量抗病基因在从野生西瓜到现代栽培西瓜的进化和人工驯化过程中丢失。国际西瓜基因组计划还开展了西瓜维管束与果实发育转录组测序,清晰绘制了西瓜植株信号传导和调控、果实成熟糖代谢与调控以及瓜氨酸代谢的基因网络。

  许勇研究员表示:“西瓜基因组序列图谱绘制完成将使西瓜功能基因组学研究和分子改良育种迈进一个全新的发展阶段,显著提高含糖量、番茄红素与瓜氨酸等复杂性状品质改良的可操作性和新品种的选育效率,对于西瓜品种改良创新和全面提升我国在世界西瓜产业的竞争力具有十分重要的意义,同时也为破解葫芦科作物基因组进化与重要性状形成的分子机制等理论研究奠定了坚实的基础。”

我要发布

  • 热点视频
  • 影视剧
  • 综艺
  • 原创
锦绣缘

同步热播-锦绣缘

主演:黄晓明/陈乔恩/乔任梁/谢君豪/吕佳容/戚迹
神雕侠侣

大结局-神雕侠侣

主演:陈晓/陈妍希/张馨予/杨明娜/毛晓彤/孙耀琦
封神英雄榜

同步热播-封神英雄榜

主演:陈键锋/李依晓/张迪/郑亦桐/张明明/何彦霓

六颗子弹

主演:尚格·云顿/乔·弗拉尼甘/Bianca Bree
龙虎少年队2

龙虎少年队2

主演:艾斯·库珀/ 查宁·塔图姆/ 乔纳·希尔

《奔跑吧兄弟》

baby14岁写真曝光

《我看你有戏》

李冰冰向成龙撒娇争宠

《明星同乐会》

李湘遭闺蜜曝光旧爱

《非你莫属》

美女模特教老板走秀

《一站到底》

曝搬砖男神奇葩择偶观

搜狐视频娱乐播报

柳岩被迫成赚钱工具

大鹏嘚吧嘚

大屁小P虐心恋

匆匆那年第16集

匆匆那年大结局

隐秘而伟大第二季

乔杉遭粉丝骚扰

The Kelly Show

男闺蜜的尴尬初夜

我来说两句排行榜

客服热线:86-10-58511234

客服邮箱:kf@vip.sohu.com