破坏机制在设计原则、工作原理上与传染机制基本相同。它也是通过修改某一中断向量人口地址（一般为时钟中断INT 8H,或与时钟中断有关的其他中断，如INT 1CH），使该中断向量指向病毒程序的破坏模块。这样， 当系统或被加载的程序访问该中断向量时，病毒破坏模块被激活，在判断设定条件满足的情况下，对系统或磁盘上的文件进行破坏活动，这种破坏活动不一定都是删除磁盘文件，有的可能是显示一串无用的提示信息，例如，在用感染了“大麻病毒”的系统盘进行启动时，屏幕上会出现“Your PC is now Stoned!”。有的病毒在发作时，会干扰系统或用户的正常工作，例如“小球”病毒在发作时，屏幕上会出现一个上下来回滚动的小球。而有的病毒，一旦发作，则会造成系统死机或删除磁盘文件。例如，“黑色星期五”病毒在激活状态下，只要判断当天既是13号又是星期五，则病毒程序的破坏模块即把当前感染该病毒的程序从磁盘上删除。

　　计算机病毒的破坏行为体现了病毒的杀伤力。病毒破坏行为的激烈程度取决于病毒作者的主观愿望和他所具有的技术能量。数以万计、不断发展扩张的病毒，其破坏行为千奇百怪，不可能穷举其破坏行为，难以做全面的描述。病毒破坏目标和攻击部位主要是：系统数据区、文件、内存、系统运行、运行速度、磁盘、屏幕显示、键盘、喇叭、打印机、CMOS、主板等。