可可西里地区年平均降水量总的分布趋势是由东南向西北逐渐减少。境内年平均降水量在494.9毫米～173.0毫米之间。降水量主要集中在夏季，雨季和干季分明。境内降水量在全年的分配上大部集中在5～9月，可占年降水量的90%以上，其中暖季(6～8月)可占年降水量的70%左右。由于复杂的下垫面对其上空气的加热作用，使空气层结不稳定，易导致热对流，引起阵性降水；同时，还由于海拔高、温度低，降水不仅以固态形式为主而且以阵性降水为主。另外，夜间较多，约占总量的50%以上。